W Subiekcie GT, Rachmistrzu GT i Rewizorze GT generowanie plików JPK i przekazywanie ich organom podatkowym odbywa się poprzez moduł e-Kontrole podatkowe. Z poziomu Subiekta możliwe jest generowanie plików dotyczących faktur VAT, magazynu i wyciągów bankowych. Rewizor GT pozwala generować pliki XML na podstawie ewidencji VAT zakupu i sprzedaży, ksiąg rachunkowych i wyciągów bankowych. W przypadku Rachmistrza GT istnieje możliwość wygenerowania plików z ewidencji VAT zakupu i sprzedaży oraz podatkowej księgi przychodów i rozchodów, a także ewidencji przychodów (ryczałt). Jeżeli dany podmiot pracuje na dwóch systemach, np. Rewizorze i Subiekcie, użytkownik programu księgowego może wygenerować pliki z ewidencji księgowych oraz z ewidencji programu sprzedażowego.